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# Photobioreactor Dashboard
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Sistema de monitoreo para Raspberry Pi y circuitos Atlas Scientific EZO:
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| Variable | Circuito | Dirección | Unidad |
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| Temperatura | EZO-RTD | `0x66` | °C |
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| pH | EZO-pH | `0x63` | pH |
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| Oxígeno disuelto | EZO-DO | `0x61` | mg/L |
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| Conductividad | EZO-EC | `0x64` | µS/cm |
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El sistema incluye dashboard responsive, históricos Chart.js, alarmas,
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exportación CSV/Excel, consola de comandos y panel de calibración.
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## Arquitectura
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```text
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EZO por I2C
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EZO_ACQUIRE / EZO_COMMAND
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Recolector Node ---------> data/*.json
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| logs/*.csv
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API Express <------------ Dashboard
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^
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Nginx
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```
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`EZO_ACQUIRE` obtiene las cuatro lecturas en un ciclo agrupado.
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`EZO_COMMAND` ejecuta comandos interactivos y calibraciones. Ambos comparten el
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bloqueo `/tmp/photobioreactor-i2c.lock`.
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## Desarrollo sin sensores
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```bash
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npm ci
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npm test
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```
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Ejecute en dos terminales:
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```bash
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EZO_MODE=demo npm run acquire
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EZO_MODE=demo npm start
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```
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Abra `http://localhost:3000/frontend/index.html`.
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En PowerShell:
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```powershell
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$env:EZO_MODE = "demo"
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npm run acquire
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```
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Y en una segunda terminal:
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```powershell
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$env:EZO_MODE = "demo"
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npm start
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```
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## Raspberry Pi
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El despliegue de producción usa `EZO_MODE=hardware`, systemd y Nginx:
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```bash
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chmod +x scripts/install-raspberry-pi.sh
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sudo ./scripts/install-raspberry-pi.sh
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```
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La guía de preparación, detección I2C, calibración y prueba integral está en
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[`docs/RASPBERRY_PI_DEPLOYMENT.md`](docs/RASPBERRY_PI_DEPLOYMENT.md).
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## Sensores conectados parcialmente
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Para pruebas con solo EZO-RTD conectado, limite la adquisicion al sensor de
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temperatura desde el panel de configuracion o en `config/runtime.json`:
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```json
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{
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"loggingRateSeconds": 1,
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"enabledSensors": ["temperature"]
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}
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```
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Tambien puede forzarlo temporalmente por entorno:
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```bash
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EZO_MODE=hardware EZO_ENABLED_SENSORS=temperature npm run acquire
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```
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En produccion puede dejar `EZO_ENABLED_SENSORS=temperature` en
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`/etc/default/photobioreactor` como override. Cuando esten conectados los cuatro
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circuitos, deje la variable vacia y habilite RTD, pH, DO y EC desde el panel.
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## Seguridad operativa
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En produccion configure `API_AUTH_TOKEN` en `/etc/default/photobioreactor` para
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proteger comandos EZO, calibracion, cambios de configuracion y borrado de
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historicos. El dashboard incluye un campo "Token API" que guarda el valor solo
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en el navegador local y lo envia como header `X-API-Token`.
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La API aplica comparacion de token en tiempo constante y headers defensivos
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basicos (`nosniff`, `DENY`, `same-origin`, `no-store`).
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Los POST criticos aplican rate limit en memoria mediante
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`API_RATE_LIMIT_WINDOW_MS` y `API_RATE_LIMIT_MAX`.
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## Bitacora de alarmas
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El recolector registra transiciones de alarma en `logs/alarms.csv` y la API las
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expone en `GET /api/alarms`. Se registran entradas a `WARNING`, `CRITICAL` y
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`OFFLINE`, ademas de recuperaciones a `NORMAL`.
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## Retencion historica
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`config/runtime.json` define `historyRetentionDays`. El valor puede ser 7, 30,
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90, 365 o 0 para conservar indefinidamente. El recolector poda filas antiguas de
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CSV sin cambiar los nombres que usa el dashboard.
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## Umbrales de alarma
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Los limites se guardan en `config/alarms.json`, se consultan con
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`GET /api/config/alarms` y pueden editarse desde el dashboard. Guardar cambios
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requiere `API_AUTH_TOKEN` cuando esta configurado.
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## Notificaciones
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`config/notifications.json` define canales de webhook y Telegram. El recolector
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envia notificaciones cuando una alarma persistente alcanza `minSeverity`. La API
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expone configuracion redactada en `GET /api/config/notifications`; guardar
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requiere token y nunca devuelve secretos sin redaccion.
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## Archivos de datos
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- Lecturas actuales: `data/EZORTD.json`, `EZOPH.json`, `EZODO.json`,
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`EZOEC.json`.
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- Históricos: `logs/temperature.csv`, `ph.csv`, `do.csv`, `ec.csv`.
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- Umbrales: `config/alarms.json`.
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- Frecuencia de adquisición: `config/runtime.json`.
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Los CSV usan una única nomenclatura y el formato:
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```csv
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timestamp,value
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2026-06-22T12:00:00.000Z,25.123
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```
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## Documentación
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- Estado actual: [`PROJECT_STATUS.md`](PROJECT_STATUS.md)
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- Comandos y calibración: [`docs/EZO_COMMANDS.md`](docs/EZO_COMMANDS.md)
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- Despliegue: [`docs/RASPBERRY_PI_DEPLOYMENT.md`](docs/RASPBERRY_PI_DEPLOYMENT.md)
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- Diseño extendido: [`ARCHITECTURE.md`](ARCHITECTURE.md)
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No se utiliza un driver personalizado del kernel. Linux ya proporciona la capa
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I2C mediante `/dev/i2c-1`; el protocolo ASCII, la adquisición y la calibración
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se mantienen en espacio de usuario para facilitar mantenimiento y diagnóstico.
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